Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms