Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms