Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B1Q9NRF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms