Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms