Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGLYRP3Q96LB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGLYRP3Q96LB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms