Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC112Q8NEF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms