Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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