Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms