Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms