Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms