Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms