Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms