Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL40Q2TBA0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms