Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA9Q13797 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGA9Q13797 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ITGA9Q13797 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA9Q13797 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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