Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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