Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TROQ12816 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TROQ12816 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TROQ12816 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TROQ12816 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TROQ12816 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TROQ12816 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TROQ12816 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TROQ12816 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TROQ12816 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TROQ12816 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
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