Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMOD3Q0VAK6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms