Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms