Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms