Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC25A1P53007 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A1P53007 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms