Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGCXP38435 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms