Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM23P36406 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms