Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX2P32243 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX2P32243 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms