Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms