Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B1P20020 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms