Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NGFRP08138 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NGFRP08138 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms