Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms