Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG12O94817 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG12O94817 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms