Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP2C19-202ENST00000480405 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRIM43CP-201ENST00000422468 1028 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC073488.11-201ENST00000633298 754 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms