Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms