Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CBFBQ13951 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CBFBQ13951 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms