Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CACNA1SQ13698 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CACNA1SQ13698 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CACNA1SQ13698 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CACNA1SQ13698 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CACNA1SQ13698 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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