Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms