Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms