Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL355312.2-201ENST00000455607 1541 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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