Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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