Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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