Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBEC1P41238 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms