Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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