Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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