Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRKCHP24723 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms