Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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