Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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PDCD1Q15116 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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