Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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