Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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