Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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