Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 Z97987.1-202ENST00000411708 391 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 ING4-203ENST00000412586 741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 ING4-204ENST00000423703 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 ING4-206ENST00000444704 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CASQ1-202ENST00000467691 595 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 AF250324.1-204ENST00000501825 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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NBR1Q14596 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 HNRNPA1P43-201ENST00000452680 910 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NBR1Q14596 AC026415.1-201ENST00000505404 471 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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