Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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