Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms