Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TCF23Q7RTU1 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TCF23Q7RTU1 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TCF23Q7RTU1 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCF23Q7RTU1 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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